男主原是現(xiàn)代世界普通大學生，某天偶遇算命人并被告知災禍將至，若不破解恐性命之危。因此男主接過山海玄中錄且答應完成書中各妖娘所在世界對應的任務(wù)......回家后，男主翻開山海玄中錄第一頁出現(xiàn)攻略人物，瞬間被吸入書中，由此正式開啟第一個攻略任務(wù)。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。