天授二年臘月，武則天詔令百花連夜開(kāi)放。牡丹仙面臨選擇——開(kāi)，就是順從；不開(kāi)，就是死。桃花勸她低頭——不過(guò)百年，女皇就死了。牡丹仙說(shuō)——我的選擇是不開(kāi)。 她開(kāi)始講述自己的故事。 上古時(shí)期，女?huà)z造人，她是群體本性的象征。諸神祝福人類時(shí)，壽星公種下牡丹種子，牡丹仙誕生，代表對(duì)未來(lái)的希望。蒼天誕生，代表個(gè)體本性，與女?huà)z展開(kāi)戰(zhàn)爭(zhēng)。女?huà)z補(bǔ)天，道隕化入萬(wàn)靈，群體本性成為萬(wàn)靈內(nèi)心的聲音。 伏羲被困天庭，神農(nóng)氏退位，帝俊蠱惑萬(wàn)靈為妖，人妖大戰(zhàn)爆發(fā)。炎帝的安撫政策被蒼天陰謀破壞，被迫轉(zhuǎn)為鎮(zhèn)壓，萬(wàn)靈投靠妖族，百年血戰(zhàn)。炎帝內(nèi)疚殉道。蚩尤拒絕妖族幫助，獨(dú)自戰(zhàn)斗，被擒囚禁。 五帝時(shí)代，禪讓制是群體本性的最后堡壘。夏啟被蒼天蠱惑，武力奪位，廢除禪讓制，開(kāi)啟家天下?！疤煜聻楣弊兂伞疤煜聻榧摇?，個(gè)體本性勝利。此后四千年，王朝循環(huán)，蒼天詛咒。 東漢末年，張角覺(jué)醒，高呼“蒼天已死，黃天當(dāng)立”，黃巾起義失敗，但火種不滅。 牡丹仙在歷史中經(jīng)歷了六世。第一世壽星紫，祝福未來(lái)，死于人妖大戰(zhàn)。第二世玉版白，祝福善意，陪伴曹植十年，殉情而死。第三世化為姚黃、魏紫、荷包牡丹，祝福愛(ài)情，千年后困惑而死。第四世洛陽(yáng)紅，祝福反抗，在風(fēng)雪中燃燒自己，鮮血化入泥土。 1949年，新中國(guó)成立。群體本性最終戰(zhàn)勝個(gè)體本性，“天下為公”回歸人間。 春天，邙山，六色牡丹同時(shí)綻放。牡丹仙站在花海中微笑。無(wú)數(shù)身影浮現(xiàn)——炎帝、蚩尤、張角、無(wú)數(shù)先烈。毛主席站在花海中，輕觸一朵洛陽(yáng)紅。 待到山花爛漫時(shí)，他在叢中笑。

在未來(lái)科學(xué)家制造了“盤(pán)古”這臺(tái)毀壞力超強(qiáng)的戰(zhàn)爭(zhēng)機(jī)器。公元2139年世界大戰(zhàn)爆發(fā)，“盤(pán)古”被用于戰(zhàn)爭(zhēng)。 世界大戰(zhàn)結(jié)束后，盤(pán)古被銷毀。 然而戰(zhàn)爭(zhēng)結(jié)束16年后，盤(pán)古神秘復(fù)活，并有自己的思想，覺(jué)得自己當(dāng)年被遺棄，懷恨在心，決定復(fù)仇人類，自己制造出具有行動(dòng)能力的機(jī)器，并開(kāi)始大量制造各種戰(zhàn)爭(zhēng)機(jī)器人，開(kāi)始報(bào)復(fù)人類，大舉進(jìn)攻人類。

自從人類發(fā)現(xiàn)上層大陸并大舉遷移，被留在暗夜大陸的人們只能在黑暗種族的壓迫下艱難求生。主角萬(wàn)流童年時(shí)家鄉(xiāng)被血族屠遍，全村僅有萬(wàn)流一人逃過(guò)一劫，萬(wàn)流立誓復(fù)仇。可他的仇人竟是黑暗種族中萬(wàn)年一見(jiàn)的天才加爾威廉！ 萬(wàn)流并未因此氣餒，哪怕面對(duì)常人難以承受的磨練，哪怕遭遇陷害身陷絕境，哪怕孤身對(duì)抗來(lái)自人類與黑暗種族兩方的壓迫也絕不放棄。突破！變強(qiáng)！直抵帝君之位！為了復(fù)仇，也為了改變這混亂的世界！

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

天才少年林合在參加平南省少年乒乓球錦標(biāo)賽時(shí)，遭受好朋友的背叛和陷害，而決心退出乒乓球運(yùn)動(dòng)的生涯。而在此時(shí)卻遇到了校痞曹斌，而重燃熱情，向新的目標(biāo)開(kāi)始迸發(fā)的熱血故事。