明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥靈對(duì)話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁的同時(shí)也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

佛族的三藏法師因?yàn)榕c女兒國(guó)國(guó)王約會(huì)而受到佛族與神族的誅殺，他的弟子齊天、天蓬、悟凈為了保護(hù)師父，不惜與諸神開戰(zhàn)！在混戰(zhàn)中因齊天與二郎神斗法發(fā)生大爆炸打碎了太虛幻境的中樞“通靈寶玉”引發(fā)太虛幻境的崩塌。唐僧的三名徒弟醒來后發(fā)現(xiàn)自己居然被炸到了21世紀(jì)的現(xiàn)代社會(huì)，三人失去神力。為了生存他們只好一邊打工賺錢一邊尋找回去的方法……

由于人族的貪婪，其他種族逐漸在一次次的混戰(zhàn)中隱匿了痕跡——混戰(zhàn)中水中界被納入地上界版圖，除了精靈族，現(xiàn)在地上界的情況是這樣的：異族在人族中只剩下了傳說和教會(huì)的宣傳口號(hào)，但是除了精靈族外的其他種族其實(shí)在地上界還各有活動(dòng)，只是隱藏了真實(shí)身份。拉法爾，來自天上界的精靈，由于不可告人的秘密來到人間界，遇見各色各樣的人類，并與其中三個(gè)伙伴組成團(tuán)隊(duì)一起粉碎邪惡的陰謀。