末日里的綠衣少年和蘿莉的傳奇故事核戰(zhàn)過(guò)后，殺戮開(kāi)始蔓延到整個(gè)世界。人間秩序完全瓦解，弱肉強(qiáng)食成為第一原則。在無(wú)序、狂暴的荒野上，人人都在掙扎求生。一個(gè)出身不明、單眼失明的繃帶少年——蘇，努力養(yǎng)育著從街上救來(lái)的小女孩。兩人相依為命，卻遭遇了意外。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

在人類(lèi)快速的發(fā)展下，人類(lèi)和妖怪之間的平衡被打破。隨著環(huán)境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉(xiāng)生活在人類(lèi)城市。然而妖怪卻沒(méi)有屬于自己的法律保障和社會(huì)權(quán)力，這是一個(gè)人類(lèi)為妖怪構(gòu)建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運(yùn)呢？