明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

林越穿越到了鴻蒙大陸，卻又被困在同一天整整十萬年。無論他如何掙扎，天亮后都會回到昨天。十萬年間，林越學(xué)會了所有的知識，了解無數(shù)宗門強(qiáng)者的秘密，也漸漸認(rèn)命自己逃不出輪回了……然而，就在十萬年的最后一天，林越奪走七業(yè)魔皇的未婚妻，砍斷太上長老之子的手臂，闖下大禍之后，卻發(fā)現(xiàn)新的一天為他打開了……

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……