這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

2516地球環(huán)境惡化，人類將月球改造成了一個理想國度“龜塔”。 然而只有最優(yōu)秀的人才有移民權(quán)。同時因龜塔不斷脫落細(xì)胞（破壞力極強的怪物“蜉蝣”），使地球生存環(huán)境更加惡劣。為了盡快離開地球，移民新世界，窮逼少年杜凜和伙伴們加入了機甲隊，靠擊殺蜉蝣獲取移民分，不想蜉蝣愈殺愈強，杜凜幾經(jīng)危險，就在生死未卜之時，一個神秘蘿莉出現(xiàn)在了他的生命里，杜凜獲得了巔覆整個戰(zhàn)局的力量。

天真爛漫，不諳世事的千金大小姐許倩然，因?qū)πr候見過的一位流浪武人的向往，對江湖產(chǎn)生了莫大的興趣。她纏著家里的武生教授她武術(shù)，卻又受不了辛苦的訓(xùn)練，只學(xué)了點皮毛便以為自己很厲害。一日，她的娘親逼她與富商的兒子成親，然而許倩然不愿將余生交給她素未謀面的人，便帶上丫鬟綠撫女扮男裝，離家出走闖蕩江湖。為了追求所愛，歷經(jīng)千辛萬苦，終于尋得了自己理想中的愛人，并最后獲得了皇后的祝福，迎來了幸福美滿的結(jié)局。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。