佛族的三藏法師因?yàn)榕c女兒國(guó)國(guó)王約會(huì)而受到佛族與神族的誅殺，他的弟子齊天、天蓬、悟凈為了保護(hù)師父，不惜與諸神開(kāi)戰(zhàn)！在混戰(zhàn)中因齊天與二郎神斗法發(fā)生大爆炸打碎了太虛幻境的中樞“通靈寶玉”引發(fā)太虛幻境的崩塌。唐僧的三名徒弟醒來(lái)后發(fā)現(xiàn)自己居然被炸到了21世紀(jì)的現(xiàn)代社會(huì)，三人失去神力。為了生存他們只好一邊打工賺錢(qián)一邊尋找回去的方法……

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類(lèi)與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。