在未來科學(xué)家制造了“盤古”這臺毀壞力超強(qiáng)的戰(zhàn)爭機(jī)器。公元2139年世界大戰(zhàn)爆發(fā)，“盤古”被用于戰(zhàn)爭。 世界大戰(zhàn)結(jié)束后，盤古被銷毀。 然而戰(zhàn)爭結(jié)束16年后，盤古神秘復(fù)活，并有自己的思想，覺得自己當(dāng)年被遺棄，懷恨在心，決定復(fù)仇人類，自己制造出具有行動能力的機(jī)器，并開始大量制造各種戰(zhàn)爭機(jī)器人，開始報(bào)復(fù)人類，大舉進(jìn)攻人類。

甲級戰(zhàn)犯死死惡重現(xiàn)于世，打破了本就虛偽又脆弱的和平。為了保全利益，蟲重勢力與其大打出手，揭開了大戰(zhàn)的帷幕，而引起這場戰(zhàn)爭的，卻是一個因身負(fù)詛咒才來到此地，勉強(qiáng)擦邊才通過了入學(xué)考核不久的姚命同學(xué)。殊不知，他進(jìn)入的，是一所被卷入漩渦中心，且被世人憧憬又忌憚的毀滅之地。它，被稱之為—黑幫大學(xué)。

女主陽蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽蘿開始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習(xí)語的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽蘿發(fā)現(xiàn)母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產(chǎn)生了愛的結(jié)晶，生下了自己。陽蘿有一半天書血統(tǒng)的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對陽蘿采取了回收行動。于是陽蘿一邊應(yīng)對這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。

一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統(tǒng)續(xù)作，一克帝國一統(tǒng)十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區(qū)的東伐西討、南征北戰(zhàn)，以及探秘發(fā)現(xiàn)未知區(qū)域及其他國度的奇幻旅程（根據(jù)小說一克帝國異域志內(nèi)容改編而成）。