甲級戰(zhàn)犯死死惡重現(xiàn)于世，打破了本就虛偽又脆弱的和平。為了保全利益，蟲重勢力與其大打出手，揭開了大戰(zhàn)的帷幕，而引起這場戰(zhàn)爭的，卻是一個因身負詛咒才來到此地，勉強擦邊才通過了入學(xué)考核不久的姚命同學(xué)。殊不知，他進入的，是一所被卷入漩渦中心，且被世人憧憬又忌憚的毀滅之地。它，被稱之為—黑幫大學(xué)。

男主原是現(xiàn)代世界普通大學(xué)生，某天偶遇算命人并被告知災(zāi)禍將至，若不破解恐性命之危。因此男主接過山海玄中錄且答應(yīng)完成書中各妖娘所在世界對應(yīng)的任務(wù)......回家后，男主翻開山海玄中錄第一頁出現(xiàn)攻略人物，瞬間被吸入書中，由此正式開啟第一個攻略任務(wù)。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。