神族少女為了保護家人，瀕死之際將軀體貢獻給了魔尊，請求魔尊庇護自己的家人。擁有新軀體的魔尊偶遇了一位特殊體質的人族少年，少年與魔尊的故事即將展開……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

少年生活在一個人類與怪物共存的大陸—紙風車之國，平靜的日常下危機四伏…