九千年前，仙武帝尊率領(lǐng)百萬神將打入太古洪荒，卻無一人歸來，只有一縷真火遺留世間。 九千年后，門派廢徒葉辰，被趕出宗門，無以為家，機緣巧合之下偶得真火，再踏仙武之路。 這是一個神魔仙佛并立的世界，這是一個諸天萬域混亂的年代，葉辰的逆天征途，由此開始。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

在人類快速的發(fā)展下，人類和妖怪之間的平衡被打破。隨著環(huán)境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉(xiāng)生活在人類城市。然而妖怪卻沒有屬于自己的法律保障和社會權(quán)力，這是一個人類為妖怪構(gòu)建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運呢？