一克帝國(guó)英雄傳2承接一克帝國(guó)英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統(tǒng)續(xù)作，一克帝國(guó)一統(tǒng)十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區(qū)的東伐西討、南征北戰(zhàn)，以及探秘發(fā)現(xiàn)未知區(qū)域及其他國(guó)度的奇幻旅程（根據(jù)小說一克帝國(guó)異域志內(nèi)容改編而成）。

三千位面管理者女主神綾清玄意外死亡，為了尋回生命和記憶，必須不斷穿越位面，攻略位面中的反派男主，阻止其黑化。為了把小黑蓮男主染回小白蓮，女主神用她的實(shí)際行動(dòng)告訴圍繞在男主身邊的妖艷賤貨們：無論哪個(gè)世界，你爸爸還是你爸爸！

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。