原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

千年蛇妖趁封印變?nèi)跆恿顺鰜砗蟊焕习逅?，機(jī)緣巧合下遇見了前往陽界收回冥魂的判官大人崔鈺。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

蘇進(jìn)因?yàn)橐馔馑劳龃┰降搅肆硪粋€時空，在這里他見證了另一個版本的華夏文明——X宮變成了古玩街，樂X大佛垮了一半，敦X壁畫被風(fēng)沙侵蝕，莫X窟變成了無頭窟。文物破損，修復(fù)技術(shù)流失，他決定用自己的技術(shù)成為一名修復(fù)師，從事他最愛的文物修復(fù)工作，改變這個世界！