原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

十萬年前，忘仙宗老祖陳玄無敵于天下卻在巔峰時退隱，無人知曉，他是因系統(tǒng)金手指故障無法繼續(xù)突破，擔(dān)心晚節(jié)不保，才隱居世間的。某天，宗門后代女弟子前來求救，卻讓系統(tǒng)成功重啟……只要培養(yǎng)后代，他可以繼續(xù)變強(qiáng)，可以繼續(xù)獨(dú)斷萬古！躲了十萬年的玄天帝，帶著全新的金手指出山了……

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燕赤霞在家門遭變之后，看透世人的貪嗔欲愛，決心潛心修道。他的師傅為了試煉他，讓他只身去黑山捉妖。在試煉的過程中，燕赤霞遇上了不顧他人勸阻夜宿鬼寺的落魄書生寧采臣，二人成為鄰居。寧采臣偶遇女鬼聶小倩，兩情相悅。但小倩是被樹妖姥姥控制的鬼魂，專門迷惑精壯男子代姥姥吸取陽氣。寧采臣欲救小倩脫離姥姥魔掌，但苦于姥姥功力深厚，小倩無法脫離其魔掌。二人遂向燕赤霞求救，一場人鬼大戰(zhàn)就此展開……