女主陽(yáng)蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽(yáng)蘿開(kāi)始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習(xí)語(yǔ)的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽(yáng)蘿發(fā)現(xiàn)母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產(chǎn)生了愛(ài)的結(jié)晶，生下了自己。陽(yáng)蘿有一半天書血統(tǒng)的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對(duì)陽(yáng)蘿采取了回收行動(dòng)。于是陽(yáng)蘿一邊應(yīng)對(duì)這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

為防止門人脫離學(xué)派宗旨，墨家設(shè)有不為人知的組織“本墨”，以秘術(shù)監(jiān)視、協(xié)助墨者開(kāi)展兼愛(ài)天下的理念。戰(zhàn)國(guó)末期，墨家三分，遙遠(yuǎn)、云飛、司空曼作為秦、楚、齊三國(guó)的本墨，為了彼此共同的理想，展開(kāi)了波瀾瀾壯闊的戰(zhàn)國(guó)旅程