為防止門(mén)人脫離學(xué)派宗旨，墨家設(shè)有不為人知的組織“本墨”，以秘術(shù)監(jiān)視、協(xié)助墨者開(kāi)展兼愛(ài)天下的理念。戰(zhàn)國(guó)末期，墨家三分，遙遠(yuǎn)、云飛、司空曼作為秦、楚、齊三國(guó)的本墨，為了彼此共同的理想，展開(kāi)了波瀾瀾壯闊的戰(zhàn)國(guó)旅程

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

生于震那帝國(guó)的宋江，是一名正義感和好奇心強(qiáng)烈的采風(fēng)，在一次際遇中被卷入禁軍的紛爭(zhēng)中，得到“天印”的能力，化險(xiǎn)為夷。帝國(guó)能源“星石”日漸枯竭，化解這一問(wèn)題的線索，就藏在震那初代帝王所造的九顆天印中。 帝國(guó)太尉高俅聲稱(chēng)履行帝王的旨意，開(kāi)始了對(duì)天印的強(qiáng)行回收計(jì)劃。面對(duì)帝國(guó)禁軍的異動(dòng)，反抗帝國(guó)的勢(shì)力紛紛崛起。江決心要平息這場(chǎng)紛亂，一路上聯(lián)絡(luò)志同道合的英豪，率領(lǐng)著以劉武山為據(jù)點(diǎn)的反抗軍，開(kāi)始了討伐高俅。

女主陽(yáng)蘿目睹母親被吸入一本天書(shū)，為了尋回母親，陽(yáng)蘿開(kāi)始四處收集天書(shū)，并在“藏書(shū)閣”昴和男主人公習(xí)語(yǔ)的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書(shū)越多，陽(yáng)蘿發(fā)現(xiàn)母親竟然是天書(shū)里面的人物，并與身為人類(lèi)的父親產(chǎn)生了愛(ài)的結(jié)晶，生下了自己。陽(yáng)蘿有一半天書(shū)血統(tǒng)的事瞬間引起了很多藏書(shū)閣的注意，并對(duì)陽(yáng)蘿采取了回收行動(dòng)。于是陽(yáng)蘿一邊應(yīng)對(duì)這些藏書(shū)閣，一邊加快速度收集天書(shū)。