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一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統(tǒng)續(xù)作，一克帝國一統(tǒng)十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區(qū)的東伐西討、南征北戰(zhàn)，以及探秘發(fā)現(xiàn)未知區(qū)域及其他國度的奇幻旅程（根據(jù)小說一克帝國異域志內(nèi)容改編而成）。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

丞相千金李令瞳一夜之間淪為罪臣之女，被剝奪準(zhǔn)太子妃身份，貶成奴仆關(guān)押在親戚家，飽受欺凌。遠(yuǎn)在邊疆的青梅竹馬、關(guān)押審訊的親爹、失蹤的老弟，內(nèi)憂外患的她卻又被賣給了權(quán)傾朝野的妖孽太監(jiān)——宮司墨。原以為自己會被虐待，對方卻將自己視若珠寶地圈養(yǎng)起來，時(shí)不時(shí)懇請她讓自己喝點(diǎn)血什么的