原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

公爵家的千金小姐莉莉，大婚前夜卻撞破了未婚夫王子與姐姐私通，被二人喂下毒藥，丟進(jìn)荒郊。命懸一線時(shí)，被戴著面具的怪物所救，怪物自稱王儲艾薩克，中了一種月圓之夜會變身嗜血怪物的詛咒，只有莉莉的血能緩解。艾薩克承諾幫莉莉復(fù)仇，作為交換，莉莉需要嫁給自己，并幫他尋找解決詛咒的方法……

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……